Banques de données

 

Bases de données moléculaires

 

Les fichiers .edi, .fasta, .pdb ... sont utilisables avec Anagène / Géniegen / Genigen2.

Geniegen2 référence de nombreux fichiers couramment utilisés. 

 

Parmi les banques scientifiques de séquences (International Nucleotide Sequence Database Collaboration), on peut trouver des fichiers plus rares correspondant à un besoin pédagogique précis :

- EMBL Nucleotide Sequence Database (EMBL-Bank) European Molecular Biology Laboratory http://www.ebi.ac.uk/embl

- DNA Data Bank of Japan (DDBJ)  www.ddbj.nig.ac.jp/

- GenBank = NCBI pour toutes les séquences de nucléotides publiquement disponibles et de leur traduction en protéines http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide

- Protein Data Bank: http://www.rcsb.org/pdb/home/home.do

 

Avec des sites dédiés à des ressources plus ciblées:

- Pour les enzymes : http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/enzymes/

- Pour les molécules simples inorganiques : http://www.faidherbe.org/site/cours/dupuis/banque.htm

- Pour les molécules organiques et minérales du sol : https://virtual-museum.soils.wisc.edu/

 

Bases de données pour les objets en 3D

 

 

Bases de données pour les sorties virtuelles